Красимир Каракачанов е автор на статии в исторически издания и множество публикации в българския периодичен печат, свързани с националноосвободителните борби на българите в Македония и съвременните взаимоотношения между Република България и Република Северна Македония. Автор е на книгите „ВМРО – История на една борба“, „Тодор Александров“, „Забравените апостоли на Македония“.